Veliki broj bifidobakterije živi u crevima zdravih ljudi. Najnižiji predstavnik je novorođenčad koji jedu majku . 99% svoje crevne bakterijske flore su bifidobakterije. Budući da bifidobakteria mogu proizvesti sirćetnu kiselinu i mliječnu kiselinu, pH vrijednost u crijevima ima snažno kiselu, tako da može inhibirati rast patogenih bakterija i spriječiti da se ljudsko tijelo zarazi.
Zbog toga novorođenčad koji piju majčino mlijeko imaju manje proliv ili enteritis od onih koji piju mlijeko, a stopa smrtnosti je također niža. Naravno, to je istina ne samo za novorođenčad, već i za novorođenčad i odrasle. Što više bifidobakterije dominira u crevima, manje je vjerovatno da će biti invazije patogena i zaraženih bolesti.